一组研究人员优化了10种常见疾病的多基因风险评分，使其适用于不同的人群。这项工作是将遗传数据与医疗记录相结合的更广泛努力的一部分，旨在加强个性化和预防性医疗保健。来源:SciTechDaily.com
作为国家的一部分在广泛的合作下，Broad临床实验室的研究人员优化了10个多基因评分，用于临床研究，作为如何实施患者遗传风险预测研究的一部分。
通过分析一个人基因组中数百万个微小的遗传差异，研究人员可以计算出一个多基因风险评分，以估计一个人一生中患某种疾病的几率。在过去的十年里，科学家们已经开发出了几十种疾病的风险评分，包括心脏病、肾病、糖尿病和癌症，希望有一天患者可以利用这些信息来降低任何疾病的高风险。但是，确定这些测试是否对所有人群有效，以及它们如何指导临床决策，一直是一个挑战。
临床研究进展
现在，麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的一组研究人员与美国10个学术医疗中心合作，已经实施了10项用于临床研究的此类测试。在2月19日发表在《自然医学》上的一项研究中，研究小组概述了他们如何选择、优化和验证10种常见疾病的测试，包括心脏病、乳腺癌和2型糖尿病。他们还调整了测试，以适用于非欧洲血统的人。
不同人群的合作努力
科学家们与国家电子医疗记录和基因组学(eMERGE)网络合作，该网络由国家人类基因组研究所资助，研究如何将患者的遗传数据与他们的电子医疗记录整合起来，以改善临床护理和健康结果。10个合作医疗中心是该项目的一部分，招募了2.5万名参与者，而布罗德研究所(Broad Institute)子公司布罗德临床实验室(Broad Clinical Labs)的研究人员则为这些参与者进行多基因风险评分测试。
“关于多基因风险评分及其在临床环境中的效用和适用性，一直有很多正在进行的对话和辩论，”布罗德临床实验室(Broad clinical Labs)首席科学官尼尔·列侬(Niall Lennon)说。他是布罗德研究所的科学家，也是这篇新论文的第一作者。“通过这项工作，我们已经迈出了第一步，展示了这些分数在不同人群中的潜在优势和力量。我们希望未来这类信息可以用于预防医学，帮助人们采取措施降低患病风险。”
消除祖传偏见
大多数多基因风险评分都是基于主要来自欧洲血统的人的遗传数据开发的，这引发了人们对这些评分是否适用于其他血统的人的质疑。
为了优化不同人群的多基因风险评分，列侬和他的同事们首先梳理了文献，寻找至少来自两种不同遗传祖先的人的多基因风险评分。他们还搜索了表明患者可以通过药物治疗、筛查和/或改变生活方式来降低疾病风险的分数。
列侬说:“重要的是，我们不能给人们提供他们无能为力的结果。”
研究小组选择了10种疾病作为多基因风险评分的重点:心房颤动、乳腺癌、慢性肾病、冠心病、高胆固醇血症、前列腺癌、哮喘、1型糖尿病、肥胖和2型糖尿病。
对于每种情况，研究人员确定了基因组中他们将分析以计算风险评分的确切位置。他们通过将测试结果与每位患者血液样本的全基因组序列进行比较，证实了所有这些斑点都可以准确地进行基因分型。
最后，研究人员想让多基因风险评分在不同的遗传祖先中发挥作用。他们通过分析来自美国国立卫生研究院“我们所有人”研究项目的数据，研究了不同人群的遗传变异是如何不同的，该项目收集了来自美国不同背景的100万人的健康信息。研究小组利用这些信息创建了一个模型，根据个人的遗传血统来校准一个人的多基因风险评分。
列侬解释说:“我们无法修正风险评分中的所有偏差，但我们可以确保，如果一个人属于某种疾病的高危人群，不管他们的遗传血统是什么，他们都将被确定为高风险人群。”
多基因风险评分在医疗保健中的未来
优化完成后，列侬在Broad临床实验室的团队最终完成了10项测试，他们现在正在使用这些测试来计算参加eMERGE研究的25,000人的风险评分。与他们的合作者一起，他们还计划详细的后续研究，以分析多基因风险评分如何影响患者的医疗保健。
列侬说:“最终，该网络想知道，当一个人收到这些疾病的高风险信息时，这意味着什么。”
参考:作者:Niall J. Lennon、Leah C. Kottyan、Christopher Kachulis、Noura S. Abul-Husn、Josh Arias、Gillian Belbin、Jennifer E. Below、Sonja I. Berndt、Wendy K. Chung、James J. Cimino、Ellen Wright Clayton、John J. Connolly、David R. Crosslin、Ozan Dikilitas、Digna R. Velez Edwards、Feng QiPing、Marissa Fisher、Robert R. Freimuth、Tian Ge、The GIANT Consortium我们所有人的研究项目，约瑟夫·t·格莱斯纳，亚当·s·戈登，坎迪斯·帕特森，哈康·哈科纳森，麦根·哈登，玛格丽特·哈尔，乔尔·n·赫希霍恩，克莱夫·霍加特，李·许，玛格丽特·r·欧文，盖尔·p·贾维克，伊丽莎白·w·卡尔森，阿特拉斯·汗，阿米特·赫拉，克日什托夫·基里鲁克，伊夫蒂哈尔·库洛，凯蒂·拉金，妮塔·林迪，乔德尔·e·林德，露丝·j·f·卢斯，丽莎·j·马丁，李·麦卡锡，伊丽莎白·m·麦克纳利，詹姆斯·b·梅格斯，特斯法耶·b·梅尔沙，Jonathan D. Mosley, Anjene Musick, Bahram Namjou, Nihal Pai, Lorenzo L. Pesce, Ulrike Peters, Josh F. Peterson, Cynthia A. Prows, Megan J. Puckelwartz, Heidi L. Rehm, Dan M. Roden, Elisabeth A. Rosenthal, Robb Rowley, Konrad Teodor Sawicki, Daniel J. Schaid, Roelof A. J. Smit, Johanna L. Smith, Jordan W. Smoller, Minta Thomas, Hemant Tiwari, Diana M. Toledo, Nataraja Sarma Vaitinadin, David Veenstra, Theresa L. Walunas，王哲，魏伟琪，翁春华，Georgia L. Wiesner，尹显勇和Eimear E. Kenny, 2024年2月19日，《自然医学》DOI: 10.1038 / s41591 - 024 - 02796 - z
涌现网络的这一阶段是由联合国发起和资助的美国人类基因组研究所。
